・MySQL 接続成功。
・CoreTelephony Trace File Error もでなくなった。
tmp の権限がおかしなことになっていたようで、このディレクトリに chmod をかけることで、解決。
sudo chmod 1777 /private/tmp
参考サイト
http://kb.odin.com/jp/119334
http://askubuntu.com/questions/633857/why-i-cant-write-a-file-in-tmp-even-when-it-is-rootroot-and-has-t-flag
https://johnsonsu.com/mac-yosemite-mysql-unable-start-reason-255/
ただし、
El Capitan では、MySQL 5.7 が推奨バージョンのようなので、引き続き、MySQL のアップグレード方法を検討。
http://www.mysql.com/support/supportedplatforms/database.html
このハード、いつまでもつかな。